Статья посвящена развитию методологии и методов доказательной экологической экономики в интересах разработки информационной базы и инструментария обоснования управленческих решений в сфере экологии. Обоснован состав и методы получения социально-экономических и экологических показателей состояния эколого-экономических объектов. Рассмотрены основные направления исследований в сфере экологической экономики. Обоснованы методологические подходы к построению оценок социальной и экономической эффективности деятельности, приводящей к изменению экологических активов. Представлена обобщенная структура показателей, характеризующих состояние и изменение природных ресурсов и выраженных в форме запасов и потоков. Для оценивания экологических активов предложено выделять данные трех уровней: первичные признаки (первичные параметры); показатели; результаты моделирования. В качестве примера приведен возможный состав показателей, определяемых по данным дистанционного зондирования земли в районе порта, как источника неблагоприятного воздействия на экологические активы. Обоснована целесообразность использования статистических моделей согласованной динамики социально-экономических и экологических показателей для анализа сценариев эволюции экономико-экологической системы.